自西元20XX年,人类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后,便开始对它进行研究,后来有人重建出来所谓的“神之语言”,并建立电脑程式以启动原始索哈尔,进行和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波动存在)连结的连结实验,但很不幸地,从上位领域流入下位领域的能量造成了事象变移,使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎完从从宇宙中“消失”,人类因而被迫逃亡,离开地球。 到了四千年多后,在故事开始前十五的T.C.4753年,米尔奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件,在此次事件当中,米尔奇亚行星的人类疑似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击,并在冲突事件后消失,但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。在事件后,启动原始索哈尔(后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体,因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔)所需的神之...。五百年前的至尊宝,在水帘洞放下金箍,没有成为齐天大圣,孤身一人去营救被牛魔王逼迫成亲的紫霞,观世音在至尊宝命悬一线之际,出手制服牛魔王,至尊宝同紫霞有情人终得眷属。
五百年后,至尊宝多活了百年,同紫霞在一起的日子,是那样的平凡、幸福。
有一天,紫霞不见了,至尊宝在寻找紫霞的过程中明白,自己这么多年不老,是紫霞用她的仙寿,延续着自己的生命。为救出紫霞仙子,他重新前往水帘洞戴上了金箍,当牛魔王再次战败,至尊宝才知晓,紫霞并未被牛魔王抓住。至尊宝终于在盘丝洞见到了紫霞。紫霞的仙寿耗尽。观音菩萨告诉至尊宝,只有至尊宝再次成为齐天大圣,才能继续活下去。至尊宝牵起紫霞的手,两个人深情一吻,似乎又回到了五百年前各自年轻的样子。
在五指山下,至尊宝日夜思念着紫霞,直到那个牵马的年轻人到来,孙悟空才有机会跟人说说话,讲述出这一段往事。。