在险恶的日据时代,赛德克族被迫失去自己的文化信仰,男人须服劳役不得狩猎、女人帮佣不能编织彩衣,骁勇善战的英雄莫那鲁道(林庆台 Ching-tai Lin 饰),见证三十年来的压迫统治。因一场误会种下日警和赛德克族的紧张关係,自此族人便活在恐遭日警报复的阴霾中,忍辱负重的莫那鲁道在深思后,虽知将面临灭族危机,但他明白唯有挺身为民族尊严反击,才能成为真正的赛德克人,于是决心带领族人循着祖灵之训示,夺回属于他们的猎场……。时为明朝末年,奸佞当道,世间离乱。强梁啸聚的锦衣卫雄霸一时,无奈江湖上少林中人扶危济贫,匡扶正义,令锦衣卫头目王澄恨之入骨。为此,他想出一条毒计,命得力手下祁天远化名金光寺僧人了空,伺机潜入少林,图谋成为主持以号令天下。少林弟子惠能得悉王澄阴谋,连夜赶回少林,途中在草原帮助少女林樱一家勇拦惊马。与此同时,王澄率锦衣卫进入少林,逼迫住持圆慧让位祁天远。祁天远与圆慧比武,暗下毒手。关键时刻惠能及时赶到,并从住持手中得到象征少林正法的木棉袈裟。为有朝一日复兴少林,惠能保护袈裟遁走,而祁等紧追不舍。
正邪对抗的千古传奇由此流传……。