描绘的是非常普通的主角一边为工作而烦恼,一边通过塑胶模型而成长的故事。性格,容貌,喜欢的东西,感觉和价值观等所有东西都是平均类型的小向璃子,在活动企划公司工作,在公司中也被称为“のほ本部门”的活动3部所属的璃子,某日被同事说成量产型的人。这时,突然对在街上发现的模型店很在意,看到了写着量产型的TV动画系列《机动战士钢弹》中登场的扎克,在店主的推荐下,第一次挑战组装塑胶模型。。接續前作“哥吉拉X機械哥吉拉”的故事,一年前與哥吉拉(Godzilla)的決戰,機龍(機械哥吉拉Mechagodzilla)受損程度37%,失去了右腕及終極武器-絕對零度炮。 維修組員中條義人在八王子基地負責修復機龍的工作。某日中條在他叔叔信一的別墅家渡假時,嬰兒島的小美人精靈竟然出現在他們眼前。小美人給他們一個忠告:人類用哥吉拉骸骨製造出機龍是個嚴重的錯誤,如果出動機龍,摩斯拉就會變成人類的敵人。於是信一設法說服老友也是身為總理大臣的五十嵐,希望能中止機龍的計劃。但就在此時,太平洋又出現哥吉拉的影蹤… 2004年是哥吉拉登上大銀幕的50週年,上一部作品“哥吉拉X機械哥吉拉”中,以1954年第一代哥吉拉的骨骸做成的機龍首次登場,與哥吉拉展開熾熱的戰鬥。在這次,哥吉拉同類的戰爭終於接近尾聲。關鍵就在曾經襲擊過東京的摩斯拉與嬰兒島的小美人。一直守護著摩斯...。