太子自小被白虎抚养成人,爱护有加之余还把他训练成一具最有效用的杀人机器。为更好的控制太子,白虎在太子十六岁生日那年,送了一名美貌异常的少女玉凤给他作礼物,从此太子便纵情于情欲与杀人的生活里,但在太子的脑海经常出现一幅幻象,如梦的与一少女在草地上闲坐着。一次,当太子受命杀人时,竟偶然碰上歌星翠儿,她的样貌一如太子的梦中情人。邂逅翠儿后,太子在性情上有了很大的转变,并对杀人这本视为理应的事感到厌倦。白虎见及此,伪装若无其事,并答应太子干完最后一件任务后便可洗手不干。他安排太子暗杀他们的头号敌人青龙,而就在最紧要的关头时,他告诉太子青龙就是他的亲生父亲。太子如何面对这个突然而来的血肉关系?而究竟玉凤与翠儿谁又能获得太子真正的爱?。银魂完结篇即将上演,坂田银时(杉田智和 配音)在影院抓住一个盗录的电影小偷,谁知刺眼的白光之后,他却被带到一个颇有些陌生的世界。不远处的江户,曾经的繁华早已不再,高楼大厦已变成没有人居住的废墟。原来此刻银时正身处五年后的未来,过去的岁月里,名为“白诅”的神秘病毒恣意蔓延,导致世界濒临毁灭边缘。他在荒芜的街道见到了飒爽英姿的志村新八(阪口大助 配音)和武功高强的神乐(钉宫理惠 配音)。似乎未来世界的银时当初为调查白诅而意外死亡,新八与神乐继承了他和万事屋的遗址,与一切恶徒作战。
化名阿珍的银时回到破败的街道和朋友们身边,此时他仿佛背负起改变黑色未来的重大使命……。