C.E.70年2月,地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月,在“非我即敌”的观念驱使下,地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候,少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后,背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后,他成为了ZAFT的战士......。肃杀之夜,一架军用飞机坠毁南极大陆,机组人员全部身亡。
美国位于南极洲的阿蒙森·海斯科特科学研究基地,此时迎来一年一度的圣诞假期。已在此工作两年的美丽女警凯莉·斯泰德克(凯特·贝金赛尔 Kate Beckinsale 饰)正准备回国度假,但就在这一关头,研究站接到发现尸体的报告,凯莉只得和一队人马前往调查。他们在一座峭壁前发现一具死状凄惨的尸体,经过勘察,凯莉得知死者是一名来自英国科考队的地质学家,而他死亡的背后似乎另有隐情。是时,强烈的风暴即将来袭,凯莉不得不中止行程,马不停蹄调查这起案件,希望在风暴来袭前查到凶手。在这一过程中,隐藏已久的秘密也渐渐浮出水面……。20世纪60年代,美国的势力向亚洲渗透,为此政府实行的一项绝密计划——战士再造计划,通过药物注射等手段将士兵大造成冷血无情、实力强悍的超级战士。随着技术不断改进,在罗伯特·柯林博士的主持下又开启了白塔计划,成功打造出更为完美的第二代超级战士。然而一次意外后12名二代战士逃亡,而涉嫌叛国的柯林博士也被驱逐东欧。此后不久,再造战士占领切尔诺贝利,美国军方决定派出4名尚存的一代战士前去击垮那群危险怪物,但是他们全部遭到无情屠戮。
走投无路之际,军方只能派出第五名一代战士卢克·戴沃洛克斯出马,对抗强大的对手安德鲁·斯科特……。