富家公子左之乔在父亲去世后流离失所,因无法承受此般落差而沉沦,在善美的帮助下重拾信心,但一番波折后却再次一无所有,却发现这一切竟是父亲一手策划。。华灯初上的夜晚,哥谭市正在举行盛大的年度人物颁奖晚会,野心勃勃的总统候选人莱克斯·卢瑟输给风流倜傥的布鲁斯·韦恩,心有不甘。正在掌声雷动的时刻,小丑带领爪牙大闹典礼,洗劫钱财。关键时刻,蝙蝠侠和罗宾及时赶到,将这伙盗贼绳之于法,送入牢房。而莱克斯为了除掉绊脚石蝙蝠侠和超人,秘密研制新式武器,放跑了大牢中的小丑一伙。在此之后,小丑等人在各地展开一连串的破坏行动,正义的战士一次次勇敢迎战。
莱克斯与超人之间的战争全面拉开序幕……。创圣纪0011年的地球,由于11年前的大异变,人类丧失了2/3的人口。 南极冰山溶化,1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世,拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市,捕获人类,摄取生体能源「Purana」。 另一方面,人类决心反击,从海底遗迹发掘岀三台组合(hybrid)战斗机「Vector Machine」。这是1万2千年前,将堕天翅族逼入灭亡绝境的传说中的兵器。Vector Machine经过合体,「机械天使Aquarion」即将现身。 要启动Aquarion,需要能与机体的机械生命感应和共鸣,称为「Element」的人。这要求特别敏锐的五感和纯真的灵魂,因此十五岁左右的少年少女们被选为机师,集中起来。 而后,「机械天使Aquarion」合体的时刻终于到来…。