建造于郊外的工厂旧址的巨大集合住宅。最近,女高中生的诡异尸体被发现,难以理解的灵异现象遭到目击等等,种种传闻不绝于耳的地方。搬家到此处的18岁女大学生凛,因一个偶然的契机而遭遇了怪异。对死亡的诅咒感到恐惧的她,在与探查这所建筑物之谜的民俗学者时世,以及咒术师斋恩等人相遇的同时,自己也逐渐逼近怪异的真实面貌。。20世纪末,世界各地的天才少年组成了一个名为"炼金之星"的组织,其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员,靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后,投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性毁灭招来体"进行的誓死决战中;另一方面,已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为:对于地球而言,人类才是真正的癌细胞。他凭着"蓝光"的威力,变身成与"盖亚"相对立的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏,盖亚·奥特曼其最大的变化在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人出生的"人类奥特曼"的登场。当然,他俩的战斗场面也属前所未闻。同时,二人的对立观点贯穿前半段,因此前半段贴近于连续剧。。从创世之初开始,正邪两种力量便一直在斗争,他们一方修炼能够起死回生并预见未来的法术,另一方则结成组织不停寻找终极武器的下落。现在,一个女人的出现将影响两方的势力平衡。
女杀手艾丽卡的父母数年前被人杀死,而她自己也不幸身亡。幸有掌握复活能力的导师将她救活,又传授给艾丽卡诸多本领。在执行一次任务期间,艾丽卡和相邻的马克父女结识,这对父女间的相处让艾丽卡回想起自己曾经拥有的爱。任务目标揭晓,雇主的目标居然是马克父女。艾丽卡为了保护父女二人,不惜与杀手集团作战。。