故事讲述的是在一座看似普通实则“暗流涌动”的边境小城,边防临时检查站站长何中华给即将高考的女儿打了电话,因为工作太忙一直没有很多时间陪伴女儿的何中华很愧疚,答应一定会陪女儿高考。挂断电话,何中华开始进入工作状态,例行边防检查,谁知这次过境的人是伪装起来的毒枭,双方在边境开火,何中华不幸中弹因公殉职。。神医元默与燕雀二人原本在凌华山编撰医书,研究疑难杂症,但一场莫名的病症打破了他们平静的生活。为研究出此病的救治方法,元默带着燕雀下山了。在这期间,一个名叫万刃阁的组织横空出世,圣子云定与圣女云止水声称带来了治病的圣水,并在四处分发中成功笼络了民心,一举成名。然而,元默研究后发现,所谓的圣水并不能根治此病,只是可以缓解病痛。与此同时,他也逐渐发现,此病竟是一种故意投放的剧毒。彼时,万刃阁乘风而起,教众已遍布各地,云定与云止水二人开始争夺教主之位,而燕雀竟然也与万刃阁有着说不清的关系。燕雀的真实身份是什么?万刃阁究竟有着怎样的目的?元默又会如何解开层层谜团,救治众生?。