本片改编自花泽健吾的同名漫画,讲述了曾经辉煌一时的日本忍者,在战后被GHQ解散组织而消失,不过,他们潜伏在世界的所有机关,现代也暗中活动着,据说人数约为20万人。但基层忍者经常找不到工作,其中之一的云隐九郎(山崎贤人饰)隶属忍者组织“NIN”的末端忍者(下忍),过着与啃老族无异的生活。一天,闲得发慌的他被判了一项重大的“忍务”,那就是调查战后70多年来一直潜入地下的某个组织的动向,其名为——“地下忍者”。忍术、智谋、最新科技等驱使了一切,从未有过的战斗现在开始。。1971年4月4日,北京香山正白旗村舒成勋的爱人在家收拾房子时,不小心把墙皮碰掉了一个口,她发现墙皮下有墨笔写的斑斑字迹,她就慢慢地剥,半天功夫就把大半墙壁揭开了,墙上面写满了字。诗文的中心位置写了一副对联,“远富近贫以礼相交天下少,疏亲慢友因财而散世间多,真不错。”当地人传说这是一副清朝时曹雪芹的好友送给他的对联,三十九号老屋的墙壁诗中出现了一副传说中送给曹雪芹的一副对联,这个老屋会不会是曹雪芹晚年住过的地方呢?更多的人表示怀疑,但后来又出现了几个重要的线索…….。