在一场史诗般的机器人大战结束一千年后,死敌佐克和平基醒来时,对他们是谁或是如何被锁在一起的记忆荡然无存。为了寻找答案,他们开始在贫瘠的荒原上漫游,寻找所有机器人的创造者拉姆——一路上结交新朋友,也结交一些敌人。但当他们回忆起过去,他们新建立的友谊会比牢不可破的锁链更牢固吗?。“医龙”再次归来!完成了日本第一例Batista手术收入后,由朝田龙太郎(坂口宪二 饰)率领的小队就被解散了。朝田回到了难民营,继续他的国际救援。之前任职的明真大学,格局也有所变化。前小组成员伊集院登(小池彻平 饰)、里原美纪(水川麻美 饰)等虽然还留守医院,但都因医院的情况精神不佳。
这时,一封不知来历的邮件发到了前小组成员的手上。邮件的内容是希望重组医龙小队。这个信息让小组的成员都感到既兴奋又忐忑。这时一位患者被送到医院,由龙太郎适时挽救了生命。借此机会,医龙小队又再次组建,一切都朝着好的方向发展着。但朝田似乎隐隐感觉着背后有人在操纵着这些事……。