当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时,约翰.哈蒙德曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后,索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇,他重新找到马科姆博士,邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸,他断然拒绝哈蒙德的提议,但当得知女友莎拉已前往小岛之时,只得跟随探险队整装出发。
在索纳岛上,另一组野蛮的探险队已经先期到达,他们抓捕恐龙将其买到外国。利欲熏心使得这些贪婪之徒全然不顾危险,竟然打起暴龙的主意。索纳岛旋即变成恐怖的屠杀地狱……。在牧野间长大的本须和秀树(杉田智和配音)因不甘心投报东京的大学失败,毅然决定来东京上补习学校。在东京街头,秀树发现街上随处可见人形电脑,在这个时代无比流行。他们有着和人别无二致的漂亮模样,连皮肤的触觉都很柔软。 穷学生秀树也很希望拥有一台但碍于其高昂的价格,只能远观。夜晚在回公寓的路上,秀树在垃圾堆里发现了少女模样的人形电脑。秀树将其扛回家,启动开关的同时也至此改变了自己的人生。苏醒的人形电脑由于只会发出“叽”的声音,因此被命名为小叽(田中理惠配音)。在秀树的教导下,小叽如同婴儿般渐渐成长,也让秀树发现了小叽与其它人形电脑的不同。有着自己意识,而非电脑程序操控的叽渐渐对秀树心生好感,但电脑与人,机器与肉体,复杂的情况让二人踯躅不前。除了秀树和小叽,还有其它人与人形电脑的故事,或悲伤或感动,在高科技的时代依然上演着最本真的温情故事。。