在一个风景如画的英国乡村,自然学家查尔斯·达尔文与妻女一起过着恬静的生活。他十岁的大女儿安妮对世界充满好奇,达尔文便教予她很多自然和科学知识,其中还包括他的进化论,然而在世人都相信上帝乃造物主的当时,女儿口中的进化论无疑是危险的,以至于令她被家庭教师体罚,就连达尔文深爱的妻子艾玛也无法认同他的观念和研究。更令达尔文受创的是,不久后,小安妮因生病早夭,唯一一个支持他完成学说的力量之源也黯淡了,整理《物种起源》手稿的工作变得犹如逆行荆棘,举步维艰……
本片改编自达尔文第三代玄孙兰德尔·凯恩斯(Randal Keynes)的传记小说《安妮的盒子》。。故事发生在现代东京。出生在英国的日本归国子女双叶夏莉纱,外号“夏洛克”,是任职于警察单位的调查顾问,她说话从不带敬语,丝毫不见日本人的迂回和客套;而橘和都医生回到日本前在叙利亚担任无国界外科医生,容易感情用事,心地善良但能力欠缺。这样的两个人组成了搭档,凭借“夏洛克”过人的推理技巧,破解一件又一件的悬案。。