在《剧场版物怪:唐伞》的激烈对决后不久,卖药郎(神谷浩史配音)再次现身,这次他来到了大奥的内庭。先前事件过后,这里正经历一场动荡。出身名门的女子大友牡丹(户松遥配音)接替歌山成为新任总管,并开始推行一种严谨而平衡的领导方式。这种高压政策逐渐加剧了她与曾受天皇(入野自由配音)宠幸的资深花魁富贵(日笠阳子配音)之间的关系日益紧张,两人之间的裂痕日益加深。天皇的妻子有希子皇后(种崎敦美配音)所生的皇子即将选定监护人,一场突如其来的事件却彻底颠覆了富贵的命运。她产下了一个被视为“不祥之子”的婴儿,被年长重臣大友(堀内贤雄配音)视为威胁,从而成为一场权谋阴谋的目标。在男权体制编织的权力之网中,利益冲突与掩盖真相的手段迅速失控。与此同时,奇怪的事件接连发生,人们无故自燃,瞬间化为灰烬。卖药郎怀疑是物怪作祟,展开调查。然而,他所面对的,是一种神秘而不断变化的群体性...。尹敏哲是一名资深的电视台节目导演,在普通的寻找新闻素材中他意外发现了一家大型医疗企业也涉及其中,于是他带着女下属开始调查真相。令人意外的是,生物技术权威的李章焕博士竟然涉嫌造假干细胞,但无奈的是他们没有准确的证据,就在这时,正义的举报者——博士团队的研究员沈敏浩出现了,他瞒着妻子和家人艰难地举报了造假者。沈敏浩的坚持让尹敏哲更加地坚定,与此同时李章焕采取了一系列非正义的手段来阻止他们的新闻报道,真相和国家权益的抗争一触即发。
本片改编自轰动韩国的2006年韩国克隆之父黄禹锡博士干细胞造假风波。。