高一那年夏天,帆高离开位在离岛的家乡,独自一人来到东京,拮据的生活迫使他不得不找份工作,最后来到一间专门出版奇怪超自然刊物的出版社担任写手。不久,东京开始下起连日大雨,仿佛暗示着帆高不顺遂的未来,在这座繁忙城市里到处取材的帆高邂逅了与弟弟相依为命,不可思议的美少女阳菜。。量古生物学学家瑞克·马绍尔提出了时光旅行的设想,并征得1500万美元的经费专门开发穿越时空的超光速粒子仪。然而公众对此并不买账,反而对其大肆嘲笑和抨击。3年来,瑞克无奈窝在一所小学里教书,自暴自弃。某天,来自剑桥的美丽女子霍莉找到瑞克,她展示了一块不可思议的化石,以此鼓励瑞克继续他的研究。
重获信心的瑞克最终制造出超光速粒子仪,他和霍莉来到化石的发现地,准备进行时光旅行的测试。在有些神经质的威尔的带领下,他们划着皮筏漂流。不料一场强烈地震突然袭来,三人被狂卷的波涛带入一个未知的世界,一场充满惊险和刺激的探险就此展开……。舞台是近未来的日本,过着普通高中生生活的才贺淳贵听闻10年前便下落不明的父亲的遗体在岩手县黑神山的遗迹中被发现,便急忙赶赴那里。然而才贺在遗迹中却看到了不可思议的幻觉。他的手腕上出现了一个金色的腕轮,上面刻着神代文字“使用者 REIDEEN”。与此同时,巨大的陨石从空中落下、湖中出现了巨大的机器人……。