宇宙世纪0153年,这个时候地球联邦已经名存实亡,统治衰颓腐朽,宇宙殖民地纷纷脱离控制,地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所;建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略,联邦军根本无法阻挡,只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会,少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员,被赋予了最新锐的机体,V高达……。为了调查双胞胎哥哥孙小糊的失踪,孙小涂参加了警队的招新考试,却在考试现场卷入警察局长遇刺事件,幸好有一直以灵魂形态存在的哥哥相助才脱险。而局长遇刺事件也牵扯出以著名脑科医生毕安为首的犯罪集团,他们通过移植承载灵魂的虫体实验,企图控制社会高层,从而掌控城市。这个阴谋被小糊以及女友夏冰警督撞破,小糊失踪之谜也随之解开。因为虫体移植会出现吞噬反应,进行了虫体植入手术的小糊和小涂只能活一个,面对毕安的要挟,小涂选择自杀来复活小糊,却被小糊抢先一步射杀了自己的身体来保全小涂。。