第六季中,故事始终以两条叙事线索展开。其中一条,他们在岛上。另外一条,他们也坐过那班飞机,但飞机没有出事,因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点,他于是一个个地去找那些曾经同机的人,用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起,相爱,幸福地生活在一起。而在岛上,他们早就因种种缘由失去了彼此。最后,杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸,他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克,在“醒”来的那一刻,真正解脱了。。位于滋贺县小波市的市民医院,当地医疗技术比较落后,虽然有京叶医大的团队驻扎坐镇,但是这些医生视前途比病人更重,对于稍有危险的手术推诿塞责,致令延误了几多患者治愈的良机。平成元年(1989年),从匹兹堡学成回国的外科医师当麻铁彦受邀来至市民医院,担当第二外科室的主任。当麻将病人的生命放在首要位置,拼尽全力做好每一次手术。他的高尚医德赢得了病患和团队的钦佩,却令高傲的京叶医大心生忌恨。某日,当麻挑战当时日本法律尚未允许的脑死肝移植手术,所有的矛盾都被推倒浪尖上来……。