Zwei的舞台是TV动画完结时一年之后。 爱莉卡虽然已经成为了Meister,但显然还不“合格”,必须继续接受玛利亚女士的指导。而另一方面,透过不断的学习,真白也更像一个女王了。 某天,新建成的天文台侦测到将有陨石从天而降,万一坠落的话,风花王国及邻近的国家将会无一幸免,Meister们要携手对抗这陨石!然而,这只是新的物语开启的序章,行星エアル有史以来最大危机于焉开幕!。一个年青人必须透过AI机器抵达宇宙的边缘,寻找他失散已久的父亲,然而他父亲所发明的AI机器,究竟隐藏何种秘密?而在宇宙的另一端将又有何种高等生命体在等待! ?。