二十世纪最后的夏天。那一天,人类终于知道自己并非地球这颗行星唯一的统治者。
巨型生物「怪兽」,以及驱逐怪兽的终极存在「哥斯拉」出现了。经历与怪兽之间长达半个世纪的战争,人类屡战屡败,最终计划逃出地球。2048年,经过中央政府管理的人工智能筛选,一部分人类乘坐跨恒星移民飞船「阿拉特拉姆」号踏上了前往11.9光年之外的「鲸鱼座τ星e」的旅程。然而,人类花费20年所抵达的星球与地球之间的环境差距远超预期,不适宜人类生存。
移民飞船上有一名青年——晴雄。4岁的时候,他亲眼目睹父母被哥斯拉杀害。20年来他始终想着回到地球消灭哥斯拉。移民的可能性已经灰飞烟灭,飞船内的生存环境也越发恶劣,以晴雄为中心的「重返地球派」成为主流,他们决定经过危险的长距离亚空间航行返回地球。
然而,地球经过2万年的演化已经形成了以哥斯拉为顶端的生态体系,完全成为了一个未知世界。
最终人类能否夺回地球?晴雄的命运又将如何?。故事发生在寻找圣杯的最后几天,当亚瑟王的武士们策马穿过一片充满黑暗、险象环生的丛林,一无所获回到卡默洛特(亚瑟王的宫殿)后,他们的队伍被解散,士气顿失。在他们中间,一位名为兰斯洛特的武士,对此次失败感到深深自责。他认为正是他和格温娜维尔皇后的偷情摧毁了这次神圣的使命。失败的阴影笼罩着一切,辉煌华丽的宫廷呈现出一个即将结束的年代的衰败气象。。