八十年前,在中国西南边城昆明,诞生了一所特殊的大学,她由国立北京大学、清华大学、私立南开大学合并而成,这就是西南联合大学。西南联大仅仅存在了九年时间,但是她的成就与光辉,已经逾越了时代和疆域的界限,成为奉献给整个世界的丰厚遗产。毕业学生3882人,却走出了8位两弹一星元勋、2位诺贝尔奖得主(杨振宁、李政道)、173名两院院士、100多位人文大师……。由于委托很少,毛利侦探事务所门可罗雀,小兰不得不精打细算,小五郎也整日靠看自己上节目的录像打发时光。某日,小五郎收到一件神秘包裹,却对柯南和小兰隐瞒再三。正在这时,一通神秘电话打入事务所,柯南接听,却发现竟是一通搭错线的恐吓电话。小五郎对此全不上心,而柯南对此念念不忘。对方的声音与服部平次颇为相似,于是他请来服部一同调查。他们按照与事务所相近的电话号码逐一打去,终于发现一个姓岩爪的宝石商人和恐吓电话有关。他们赶到岩爪的公寓,得知警方已经先行到达,不久更知晓怪盗基德似乎也与此案有关。真相究竟如何?。