两名高等法院的法官遭杀手谋杀,法学院高材生达比随后开始调查此案,起草一份该案的报告,名为《塘鹅报告》。达比找到了记者格兰,因为他是最后一名见到其中一名法官的人,希望能得到他的帮助调查此案。一天格兰接到了一个神秘人来电,此人自称知道谁是该案凶手,格兰跟踪到了此人,可惜未能拦下他。
此时,总统暗中命令相关人士不要插手此案。格兰由此起疑,随后调查到了总统和马氏集团关系密切,而且一切证据都表明,马氏与两位法官的死有着千丝万缕的关系!。X档案关闭后,穆德(David Duchovny 大卫•杜楚尼饰)和斯科莉(Gillian Anderson 吉莲•安德森饰)被分开。穆德受命执行监听工作,斯科莉则回到学院读书。 某日国会议员麦特森(Raymond J. Barry 饰)向穆德透露一条消息,称在波多黎各接收到外星人的电讯。为了在特种部队之前找到外星人的证据,穆德只身前往。得知消息的斯科莉赶到穆德住处,从电脑中的旅客名单中找到线索,尾随来到波多黎各。 在波多黎各阿雷希伯,穆德偶遇一个当地人,并从他手里得到一幅外星人的画。但不久后此人便离奇死去。穆德最终能否找到外星人来访的证据?。