令人感到十分讽刺的是,假面骑士灭亡迅雷再次成为了人类的敌人。
哉亚日本公司发生了大规模爆炸事件,而罪魁祸首竟然是灭亡迅雷站?面对新闻发布会上记者的质问,刃唯阿表示暂不做任何回应。上级也在不断施压,假面骑士巴尔坎(不破谏)与假面骑士瓦尔基里(刃唯阿)不得不做出抉择。
理解人类和修码吉亚两方立场的不破谏与刃唯阿,都有各自的坚持,是为了守护所有生命而战?还是为了自己的规则而战? 他们与假面骑士灭亡迅雷之间的战斗究竟结果如何——!?。故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中,校长是严肃又寡言的碇原度(立木文彦 配音)。作为校长的儿子,碇真嗣(绪方惠美 配音)感到压力很大。于此同时,来自外国的红发转学生明日香(宫村优子 配音),分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽(林原惠美 配音)都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外,在原作中高大帅气的初号机,也将以娇小可爱的形象,作为学院的一份子出现在动画中。
动画以《新世界福音战士》中的角色为原型,一改原作沉重严肃的气氛,描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型,配以实景背景和2D拼接,造就了多元化的绘画风格。。在遥远的未来,一班时间罪犯进行非法行为使历史也被错乱修改,所以地球也成立了公共机关“时间保护局”,来监视这些非法篡改历史的罪犯,并将他们用“冷冻压缩”的刑罚绳之以法,这时“时间保护局”收到报告,在隆德监狱所有罪犯的手下假扮成守护者,趁被冷冻之际,则趁机杀害所有的时间守护者,然后将隆德监狱据为己有,并组成了犯罪集团“洗钱帮”引诱时光机器进行时光旅行,时间设定为来到公元2000年的日本。 四位来自公元3000年的时间守护局成员优理、土门、绫濑、席恩,为追捕逃走的时间罪犯唐‧多尼洛与其“洗钱帮”的党羽,与时间保护局战队队长龙也(リュウヤ)[1]来到一千年前的二十世纪,但原来眼前的龙也队长竟是洗钱帮的莉拉(リラ)所假扮,加上时光机受到破坏暂时回不了未来世界,洗钱帮也开始为了金钱四处作恶,但是手上的五个时间变身器“Chrono Changer(クロノチェンジャ...。