本季延续前作框架,围绕科尔特·肖(贾斯汀·哈特雷饰)及其团队追踪悬案、破解谜题展开。剧情融合犯罪调查与寻宝冒险,通过团队协作揭露隐藏在黑暗机构中的势力。编剧在本季中加强了叙事力度。。阿龙(古天乐 饰)和阿虎(谢天华 饰)是情同手足的两兄弟,孤苦无依的两人在蓝田旧屋村艰难生活。阿仪(黎姿 饰)是阿虎的女友,不幸遭到贪婪的地头蛇四眼(雷宇扬 饰)的玷污,愤怒之下,阿龙和阿虎出手将四眼砍成重伤,两人因此不得不离开故乡,踏上了逃亡的旅途。
一行人来到了钵兰街谋生,在此地结识了老大寸王(徐锦江 饰)。寸王十分赏识两兄弟,让他们加入了黑帮为自己卖命,尽管阿龙和阿虎在道上混的风生水起,但阿仪和阿虎之间的感情亦因此而产生了裂痕。阿仪离开了阿虎,和大恶霸禽兽(林国斌 饰)走到了一起。禽兽十分爱慕阿仪,为了她,他宁愿与邪恶的狂人辉(徐忠信 饰)为敌。。南韩北韩即将统一,这也就意味着处于警戒线上的铁路也要随之开通。就在这个节骨眼上,日本方面出面干涉,拿出了一份在1907年同韩国政府签订的条约,指出若是开通铁路便会违反条约上的规定。
史学家崔民在(赵宰贤 饰)提出了一个有可能扭转时局的设想,那就是盖在条约上的国印系伪造,也就是说,这份条约没有任何的法律效益。想要证明国印为假,那就必须找出真正的国印,总统(安圣基 饰)全力支持崔民在的论断,并成立了寻找国印委员会。而反对方则将重点放在了维持国家安全和统一的方面,主张和日方维持良好合作关系,为了达到目的,总理(文成根 饰)甚至赋予了情报局秘书官李尚铉(车仁表 饰)抹杀崔民在的权利。。