黑人警官哈里恩.里吉斯乃华盛顿高级警务人员,专办大案。这次他接手的代号为1600的谋杀案涉及国家机密:一位在白宫任职的年轻女子在白宫内被谋杀。调查深入到一定程度,他发现这里面的复杂程度远远超出他的想象。总统身边的特工做的一些事,不知是维法还是违法,某些重大案情的档案会神秘失踪。政府高官敌我不分,立场暖昧。里吉斯警官工作起来得不到应有的支持。分管特殊事条的尼娜.钱斯被上锋告之,尽快结案。里吉斯争取到尼娜的协助,线索更多了,上至总统下至一般工作人员,似乎都有犯罪嫌疑。那么到底谁杀了人,杀人的动机又是什么呢?。黑田藩藩主齐隆侯将宠爱的妃子生的女儿滨千代公主假扮男孩,秘密继承储君之位。菩提寺住持慈善和黑锹忍者得知此事,写作秘函送往江户。拜一刀(若山富三郎 饰)受黑田藩所托,追赶主持抢夺秘函。
途中拜一刀遭遇黑田藩忍者不知火(安田道代 饰),从其口中察觉事件背后的秘密。秘函抢夺成 功,柳生烈堂(大木实 饰)派出大量刺客截杀,但全部死在拜一刀手下。黑田藩重臣肋天将监斥责齐隆侯用女儿继任储君,意欲杀其谋反。受不知火所托的拜一刀由此卷入这场继嗣风波之中……。