故事继续于1945年9月,第二次世界大战刚刚画上句点,全世界都在欢欣鼓舞地迎接着久违的和平时光。此时的塞巴斯蒂安已经成长为了一名10岁的少年,他和小狗贝勒以及祖父萨塞尔一起居住在位于圣马丁的山寨之中。两年前,塞巴斯蒂安最好的朋友安吉丽娜在战争中失踪了,她所乘坐的飞机坠毁在了阿尔卑斯山上的茫茫雪原之中。虽然所有的人都认定了安吉丽娜凶多吉少必死无疑,但塞巴斯蒂安还是不愿意放弃心中的希望。他找到了聪慧而又勇敢的飞行员皮埃尔,在后者的帮助之下,塞巴斯蒂安带着爱犬踏上了寻找好友之旅。。传说中可实现持有者一切愿望的宝物——圣杯。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯戦争。
参加圣杯戦争的7名由圣杯选出的魔术师被称为御主(マスター,英文Master),与7名被称为从者(サーヴァント,英文Servant)的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵,被分为七个职阶,以使魔的身份被召唤出来。
圣杯承认的使用者只有一个,御主(Master)一定得与七种职业的从者(Servant)之一立下契约,证明自己是有资格拥有圣杯的人。。